Em Florianópolis, a Udesc conta com quatro centros em pontos diferentes da cidade: Centro de Ciências da Administração e Sócio-Econômicas (Esag), Centro de Artes (Ceart), Centro de Ciências da Saúde e do Esporte (Cefid) e o Centro de Ciências da Educação (Faed). A Udesc possui mais seis campi espalhados pelo estado.
Só na capital, a Universidade oferece cerca de mil vagas anuais nos cursos de graduação, com dois vestibulares por ano. Os cursos são divididos pelos centros da seguinte maneira:
Esag - Administração, Administração Pública e Ciências Econômicas;
Ceart - Artes Cênicas, Artes Visuais, Design Gráfico, Design Industrial, Música Bacharelado e Licenciatura (piano, violão e violino), e um dos poucos cursos de Moda do Brasil.
Cefid - Educação Física e Fisioterapia;
Faed - Biblioteconomia, Geografia, História, Pedagogia.